KKR har flere gange drøftet spillereglerne for hvordan kommunerne vil samarbejde om udbud, efterspørgsel og kvalitetsudvikling efter hensigtserklæringens udløb i december 2008. Spillereglerne er udmøntet i to samarbejdsaftaler som netop er sendt til behandling i kommunerne.
Der er udarbejdet to samarbejdsaftaler; en generel aftale og en aftale som specifikt handler om det mellemkommunale specialundervisningsområde.
Samarbejdsaftalerne dækker samme område som henholdvis rammeaftalen og rapporten om den mellemkommunale koordinering af specialundervisningen, som KKR har behandlet i mødet den 20. august og som nu skal godkendes i alle kommuner.
Forskellen er at rammeaftalen og opgørelsen om specialundervisningen fra KFS er tilbagevendende årlige rapporter, som beskriver udbud og efterspørgsel af pladser i det kommende år. Samarbejdsaftalerne er spillereglerne for hvordan kommunerne agerer i forhold til hinanden, for at sikre den samlede forsyning og udvikling af området. Hvor rammeaftalen skal fornys hvert år, rækker samarbejdsaftalerne flere år frem. I den generelle samarbejdsaftale er der et afsnit som yderligere beskriver relationerne mellem samarbejdsaftalen, rammeaftale og det Regionale Udviklingsråd.