KL og Økonomi- og Erhvervsministeriet har i juni 2011 indgået en aftale om væksthusene i 2012. Aftalen fastlægger de overordnede nationale aktivitets- og resultatmål for de fem væksthuse i 2012. De nationale mål indarbejdes i løbet af efteråret 2011 i regionale aftaler mellem kommunekontaktrådene og væksthusene i de enkelte regioner.
Som i 2011 finansierer kommunerne væksthusene i 2012. Kommunerne kompenseres herfor over bloktilskuddet. Indenrigs- og Sundhedsministeriet har beregnet den enkelte kommunes væksthusbidrag for 2012. Ministeriets beregning kan downloades på denne side.
Pr. 1. januar 2011 overtog kommunerne finansiering og styring af væksthusene. Kommunerne bliver kompenseret for opgaven via en regulering af bloktilskuddet fra 2011 og frem. Regeringen og KL er enige om, at midlerne skal bruges til væksthusene. Dette er en del af en aftalen om væksthusene efter 2010, som blev indgået den 15. juni 2009 mellem KL og Økonomi- og Erhvervsministeriet.